Рассмотрены теоретические предпосылки для разработки модели нестационарных периодических процессов аэробной очистки сточных вод коммунального хозяйства. В основу разработки логико-математической модели положены закономерности кинетики клеточного роста и биохимических превращений органического вещества в процессах клеточного метаболизма, подчиняющегося законам ферметативного катализа. При разработке имитационной модели непрерывно работающей системы очистки на основе функционирующей пары циклотенков, действующих по одинаковым циклам, но с фазовым смещением. Введены представления о временной структуре рабочего цикла. Рассмотрены ограничения, накладываемые на длительность операций. Учтены особенности описания процессов в различных фазах и применены условия сопряжения рабочих параметров в различных фазах. Описаны процессы клеточного роста и самоочищения микроорганизмов активного ила, утилизации им органических загрязнений кинетические уравнениями модели Герберта, где удельная скорость роста микроорганизмов активного ила описывается формулой Моно. При численном моделировании приняты коэффициенты уравнения, полученные для сточных вод городского типа, наиболее близкие по составу органических и прочих загрязнений хозбытовым сточным водам.